mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGAGACAGGGTTTTGCAA GCACAGCTAATTTTTTGTATT AGTAGTTGGGACTACAGGCACAACACCACCATGCACAGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCAACGTTGTGCAGGCAGGTCTCAAACTCCTGG AACAGGGTCTCACTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTAGGATCTCAGCTCACTGCAGCTTTGATTTTTCTGGTCTCGAGTGATCCTCCCACCTCCCAAGTAGTTGGGACTACAGGCACAACACCACCATGCACAGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCAACGTTGTGCAGGCAGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCTGCCTACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTAAAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCAAGCAATTCTTAATGTACACTGAACTCCATCATTATCTAAATTGGATTTATGTATCTGATTCTTTTCATTGCAATCTATATCAACAATAATTTCCTTGGAACTCAGAGACATTCTTTGAGTCAAATTAAACAGAAATA 5 0 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 0.00002 100 -26 ((.((((((((((....(((((((.......((((.((((...((((((((.....))))))))...)))).))))..))))))).....)))))).)))).)).. (-26)