mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGATCATTGTGAAGGCAGG TGTTTTTGTACTGGTTAGATG CGGATCCAAGCAAATGGCCAATGAGATCATTGTGAAGGCAGGGGCATGTATGTGCACATCTGTTTTTGTACTGGTTAGATGAATGGCAGTTGTTATTTT GGCCGCAGGCACCTCCTCGCCAGCTCTTCCGCTCCTCTCACAGCCGCCAGACCCGCCTGCTGAGCCCCATGGCCCGCGCTGCTCTCTCCGCCGCCCCCAGCAATCCCCGGCTCCTGCGAGTGGCACTGCTGCTCCTGCTCCTGGTAGCCGCTGGCCGGCGCGCAGCAGGAGCGTCCGTGGCCACTGAACTGCGCTGCCAGTGCTTGCAGACCCTGCAGGGAATTCACCCCAAGAACATCCAAAGTGTGAACGTGAAGTCCCCCGGACCCCACTGCGCCCAAACCGAAGTCATAGCCACACTCAAGAATGGGCGGAAAGCTTGCCTCAATCCTGCATCCCCCATAGTTAAGAAAATCATCGAAAAGATGCTGAACAGTGACAAATCCAACTGACCAGAAGGGAGGAGGAAGCTCACTGGTGGCTGTTCCTGAAGGAGGCCCTGCCCTTATAGGAACAGAAGAGGAAAGAGAGACACAGCTGCAGAGGCCACCTGGATTGTGCCTAATGTGTTTGAGCATCGCTTAGGAGAAGTCTTCTATTTATTTATTTATTCATTAGTTTTGAAGATTCTATGTTAATATTTTAGGTGTAAAATAATTAAGGGTATGATTAACTCTACCTGCACACTGTCCTATTATATTCATTCTTTTTGAGATGTCAACCCCAAGTTAGTTCAATCTGGATTCATATTTAATTTGAAGGTAGAATGTTTTCAAATGTTCTCCAGTCATTATGTTAATATTTCTGAGGAGCCTGCAACATGCCAGCCACTGTGATAGAGGCTGGCGGATCCAAGCAAATGGCCAATGAGATCATTGTGAAGGCAGGGGCATGTATGTGCACATCTGTTTTTGTACTGGTTAGATGAATGGCAGTTGTTATTTTATGAAATGATTTCCCGGTGGGTGGGCCAACTTTTCTCATGGTGAAACTTTAAGAACTAAAATGTTCTAAATATCCCTTGGACATTTAAAGCCCTTTCTGGAAAGGCATACTGGCCTTTGTTTAAGGGGAAGGTTTTACCGTGGTTTCTGGCTAAAAACAAGGGGCCTTTAATAATGGAGGGGTTTTCCCTGGGAATTTTTACATTTAG 4 0 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 100 -24.9 ........(((((...((((....(((((.((((((((((((.((((....))))...)))))))))))).))))).......))))..)))))..... (-24.9)