mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTGTGCAGGGGGTGGAATA TTCCATCTCTTGCACACTGGA GTTTATGTTATATTCCATCTCTTGCACACTGGACTAGCCAGCTTTTTGTTGGCTTCAGCTTCAGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATACATCATTGA GATGCATGGACAACCTTTGAGTTCAACTCCAGCACCATTATATAAATTTTGAAATCCCTGCTTGCTAGAAAAAAAGAAGGCTTTGGTGACATGGGTTTATGTTATATTCCATCTCTTGCACACTGGACTAGCCAGCTTTTTGTTGGCTTCAGCTTCAGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATACATCATTGATATCATGGGATATAAATTTGAGTTGGATTTCTTCCAGGTTTCTGAAAAAGATGAAACAAGGGGATGGGATGATAATGCTCGCAACAAGCCATTTACGCTTGAAAACAAGCACTTCCAAGGCTGGTCGGAGGGATCTACCTTGACAATTTTAGTTATTTTATTGTGTTGCATGTTTTTTGGCCAAAGATACCGAGTCTACTTGAACAACATCCATACTCCAATGATTTAACTGATATGATTAGTTATATTCATGTTTCATTTCTTTTCCTTCCATTTCCCCCCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTATATAGATTTGTTTAGTTAAAACTAGTAGCATGTTGGCATTTGCAGCCTTTTAGAAGTGTCAATGTTTGAGATGGAAGAATAAGCTAGTTTCCATGTATGGTATAACTTTATTTTTTTGTGCTAAGTATTC 1 0 3' arm Gossypium_hirsutum mirnest 100 ghr-MIR2950 1e-49 -39.7 .((.(((...((((((((((((((((((((.((..(((((((.....))))))))).(((...))).))))))))))))))))))))...))).)) (-39.7)