mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGGAGTCCTGGGGAATGGAGA ACTGTTCACCCAGCACTAGCAG TGTTTTGTGGACTGGGCTCTCACTGTTCACCCAGCACTAGCAGTACCAGACGGTTCTGTGGAGTCCTGGGGAATGGAGAGAGCACAGTCTGACGCCC AGGGGCTCTTTTCTCCTTTCCCCTCTCCCTTGGCCCTAGATTTGGTAATCCATGAAAAAGCACAAGGTCCTGGCTGCTTGCAGTCACATTCTGGTTCTCTGTGTTTTGTGGACTGGGCTCTCACTGTTCACCCAGCACTAGCAGTACCAGACGGTTCTGTGGAGTCCTGGGGAATGGAGAGAGCACAGTCTGACGCCCTGCCAAGTAGCCAGGAGTTGACTTGCCCATGGTCCGCTGGCTTTCCCACCACTTCCTACAGGATGGGATCTAAGAGACTCAGTAGCTGGGTTTCTTTCAGCACGCTGTACTGTCCCAAGTAGCAAACAAATCACTCTGTAGCCAGATTTCTGAATGGAAATGAGAAATTGAATTCTCCATGGACTTTTAGGTTTATGGGGGAGTTTTGGTTGTGTTTCCTGGTTTTATTTCAGCCAAACATGTCTGCTTTTGATTTTTTTTTTTTTAAATTATAAGTGGTCTATATATATGTTCACCTTGTAAATGTCAGTGTTTAAAAAGAGTAAGCATTTATGTGTTTCCATAACTGACATCTGATACAGACCTCATTCTCTCCCCCTCTTCTACCCTCCTCTTTTCCCTCTTTTCATACTCTTGTATTGGTTCTAATAAATGGTTGCTTTTC 3 2 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3198-1 1e-37 -44.5 ........((((((.((((((.((((((.(((((.(((.((((.(((....))).))))..))).))))))))))).)))))).))))))....... (-44.5)