mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAAGTAACTGCGGTTTTTGC CAAAACCGCAATTACTTTTGC CATTTAATATTAGACTGGTGTGGAAGTAACTGCGGTTTTTGCCAAAACCGCAATTACTTTTGCACCTACCTAATAGG AGTTTATTATGGCTGGTTTACTCTCCCCCAAGTAAAACAGCCATACACAATTTGCTGAAATTTTCCTTAGTGTACTTTGAAATCTGTGGAACAGAACTGGCAATCGCTAAATTCTATTTGACTCTAGTTCCATTTAATATTAGACTGGTGTGGAAGTAACTGCGGTTTTTGCCAAAACCGCAATTACTTTTGCACCTACCTAATAGG 4 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000001 hsa-mir-548c 0.0000000009 -32.2 .......((((((...(((((((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))))...)))))).. (-32.2)