mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAATAATTGCGGTTTTTGC AAAATCCGCAAGTACTTTTGC TGCATCATATTAGGTTGAAGCAAAAATAATTGCGGTTTTTGCCATTAAAAGTAAAGCAAAATCCGCAAGTACTTTTGCACCAACCTAACAGCAATA TTGAGACATAGTCTCACTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCACAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTGAAAGGATATATTCAACTATTTCATACACCAAAGACGATGAAAACAAGTATGGTATTTTAAGAGGTGTTTTGCCAACTACTACTAAGAAACAGTCAGTAAAGCAGATGAGGGGGCACCATCTGAAGGGGCAGTCATTAGTATTTATTCTCAGGGAAGAGTCATTTAGCTAGTTTTACCTTATTCCAATTCTTCCTAATTTGTTCACTAAAGTTAAGCTTAGCAAGTACCTTGTTTGCAGCACTCAACAAATTACAGTTGTAGCCAATTTTGCATCATATTAGGTTGAAGCAAAAATAATTGCGGTTTTTGCCATTAAAAGTAAAGCAAAATCCGCAAGTACTTTTGCACCAACCTAACAGCAATACTTGAGAAAAGCTTCTGATTCTTTATACCTAAACCTGGACACTTCCAACATTTGGGGCCAGATAATTCTTTGTTGAGGGGGCTCCACTGCAGAATGTTTANGAGCAT 3 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 2e-18 hsa-mir-548k 1e-49 -32.2 (((......((((((((..((((((.((.((((((.((((((..(((....))).)))))).)))))).)).))))))..))))))))..)))... (-32.2)