mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAATAATTGCGGTTTTTGC AAAAACTACAATTAATTTTGT AAAGGTGTATTATGTTGGTACAAAAATAATTGCGGTTTTTGCCATTAATAGTGGCAAAAACTACAATTAATTTTGTGCCAACCTAATACATTAA CATTCAGCAACATAATACATAATATGAAAGGTGTATTATGTTGGTACAAAAATAATTGCGGTTTTTGCCATTAATAGTGGCAAAAACTACAATTAATTTTGTGCCAACCTAATACATTAAAGTTAGGGAAGGCAGCTGTCATCAGATTTTCAGGTAATTTTAAGATTAATGACTACAGACAAGTTTAGTAGTAGTCATTTATTTAATAGAATAGTTTATGCTGT 2 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.00000000009 hsa-mir-548x-2 0.0000000003 -46.1 ...(((((((((.((((((((((((.((((((.((((((((((((.....)))))))))))).)))))).)))))))))))).))))))))).. (-46.1)