mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCTGTTTTTGC AGGAGCTGCAATTACTTTTGC ACATATCTATTAGATTGGCGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTACCTCCAATGGCATTACTTTCAGTGGCAGGAGCTGCAATTACTTTTGCGCCAACCTAATATATTGA CCACGCGTCCGCCTTGTTCCTTTTTCTTTTCTTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGCGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGTGTTCAAGGGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGCACCACAGACGCACACCACCATGCCTGGCTAAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAGTGGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGTTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTGAGCCCGGCCCCTTGTTCCCTGTTCTGTTTCTTTTTCACTGTTATCACTGATCACCATCGATCATATTATCTACATATCTACATATCTATTAGATTGGCGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTACCTCCAATGGCATTACTTTCAGTGGCAGGAGCTGCAATTACTTTTGCGCCAACCTAATATATTGAGACAGGGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGCTGGAGGGCAGTGACACAATCACAGCTCACTGCCATGTCCAACTCCTGGATTCAAGTGATCCTCCCGCCTCAGTCTCCTGATTACCTGGGACTACAGGCGTGTATCACCACATC 1 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000007 hsa-mir-548c 0.00000000002 -47.2 .......((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((.....................)))))))))))).))))))))))))))))))).))))))...... (-47.2)