mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAAAAACCACAATTAMTTA ARTAATTGCAGGTTTTGCCAT GATGTATTAAGATWGGTGCAAAARTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAAGTCATGGCAAAAACCACAATTAMTTATGMACCAACCTAATATATG TAGATTGTTTCAATGCAANAAAACACAACNTTANAACCACAATAWTATTTAAAAAAGAWTTAANAAAGAAATTARGTTTTTTTTTTTTTTKTGTTGATTCTTACTATTCTCTGGCTAATCAGAGACTTCCAACCTTTTTTCTTCAAAAAGMSCATTTTTAATAGACTAAATACTGGTTATCACTGCCTTTTTGTTTAASGYACAACASCCGCATGGCTCASATGTBACTTGTCGTTCTCGGSSGGSKKSGGGGTTTTGSGTGATGAATACAGAGAAGGTAGGGSGCGCCTTTGGKTGTTTTGGGTGCCACTGTKCTCTTGGGAGGGTATTCKAGSCTTCTAGGATGSCAGAGTTAAGAACCATTTCCAAGGGGCGGGGGAGATSCAGGGTCACAACATAACTTCTGAACAAGTGTGTRCGCGTATATATATATGTATATAGATGTATTAAGATWGGTGCAAAARTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAAGTCATGGCAAAAACCACAATTAMTTATGMACCAACCTAATATATGTGTGAAACAGAGAAAAGGATGTCAAACTACTTWATTTATTTCTGKTAAATTAACTTCTGGAATTTGAAGCAAACATTTTGCTTGATCAAAATGTGTTCYTCTTCGGGGTGTTTGATCCCAATTCCATGCTAAAMACAAAACCAAACAAAAAWAGGAACTGCAAAAGCCAGRAAGTGKTACTACGTGGGGAATAARGGTTCMAATAMCTTAATKACTTTKRAAGTAGGTGTKRGGGATAAATAAAAAAGGCAAGCRTTGGSGGAACTGTCCCCAACCAGACAWTKCCWTGGRTKTYTTTCAAAMGATCATTTTTCHTTGTCTCTAAAAWYAGWCCAGRAAG 3 2 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.00000000000008 hsa-mir-548aa-1 0.00000000009 -22.9 .((((((((.....(((.((.((.((((((..(((((((((((.......))))).)))))).)))))).)).)).)))....)))))))). (-22.9)