mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGATATGAAGAAAATGCATT TGCATTGTCACATATTTTTA TCCTCTTCCTGATGCATTGTCACATATTTTTAAGGAACTTTAGGGATATGAAGAAAATGCATTAAAGCGGGT TTTTATTTAAAACCATCAGAGTTTAAGAAATACGAATATAAGACAAATAAAACCTGGTGAGTTATTAAACCCATTTTCTATATACAAATACTAAAATTCCCAAAGTGGAATATCATCCAATGTGAGACACATCATAGCACGGTCCATATGTACACGGCACACAGAGCTCTGCCTGCGCTCATCTGTGAATTGCTCATTACATGTCACTGATAAAAAAATCTGCAAGGGAACTTCTACTCTTCAGTTCTCCTCTTCCTGATGCATTGTCACATATTTTTAAGGAACTTTAGGGATATGAAGAAAATGCATTAAAGCGGGTTTCTGCTAAGGGCTCTGCATGTTTTGCTCTGATCAATCACGCACTACATCTTGAGAAAAACTTTTGCAACTTATTTCCAGTACAGATAGCAGAAAACTCTAGGTTTTTGCCAATTTATTTTTTACTAGTCACTCATTGCAACACAAGTGCAACATCAACAGCTCAGGAACCAAATTATGTTTTTATATTGCGTAGTTTATTATTTAATGCCTCTTATTTTTAAGAAGCCTTTAAAAGGACACTTACTGAATAATAAAAAGGGTCTAAGTTCCAAGTTTCTCGCTGCTTGACAATGACCCATGATTATAACCCCTATGTTACAGATCACATCCACGCTTAATCGATACGCTTTTCTATTTAAGGTATAACTACCATTTCTATTGTTATCTTTCTTTTGCCTACTTTTACAATCAATCAGTGTTAGGTTTTTGTGTTCTGCTCGCTACTATCTCTATGCAATTCTCGTTCTGTTAACCCTATCTTTTTTCTCTCTCGAAACTTTCATCAACTACTATCGTTCGTTTAATAATTGGTTTTTAGGTCCTCTTTTCAAGTCCCCA 2 1 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 100 -20 (((.(((..(((((((((.((.((((((((((((....))))))))))))..)).)))))))))))).))). (-20)