mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATGATACAGGTGGAGGTAG ACTTCTACCTGTGNTATCATA TCTTCGTAGGTTATATATGTCTACTTCTACCTGTGNTATCATAATAAAGGTGTCATGATGATACAGGTGGAGGTAGAAATATATAACTTATCTCT GNCGGCCTACCTAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCAGTGCACTGGCCTATTATCTCTTTTTAACAAAGAATTAAGAAATCTAATATTCTTTCCCAAGATCGTACAAAGAATTGTGGCAAATTAGGAATTAGATTTTTGTCTTAATTCAAAACCTGGTATTTACCCCAGTGTGCCAAACAGCTTTATAATGAAGACAACATTAATCAAGCATCACATTTTTAAAGGCATATATCTATTTTTTTGGCTATGCAAAAAACCTTGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTGGCTAGGCATTTCAAATGTGATACAATAAAATATTAACACAAAAGTAATTTCTATTTATAAAATTTAAAATGGCAGGTTTTCTGTGTGACGTTTGAGTTTGAGATGATTTGACTGGCATGAGGCCCATCATTGGGAGGTAAAAATTACAGCACAAAGAAAACTAAGCAGGTGCATATGAGGTATTGTCTCTTTATGCTCATCAAAAAATAATCTCCAAAAGAAAAGTTAAAAAAATTATTGTTATAAATTGCATGAAATACATAGTGGGCTCGATTCATAGCCCCCGTCCGTATCTATATCTCTATATCTATAGAGACATAACTTCTTTCTTCGTAGGTTATATATGTCTACTTCTACCTGTGNTATCATAATAAAGGTGTCATGATGATACAGGTGGAGGTAGAAATATATAACTTATCTCTTCATAAGGGCTAAAAATGAGAACTAAAAGTA 1 0 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3682 7e-39 -43.9 .....(((((((((((((.((((((((((((((((.((((((.(((....))).)))))).)))))))))))))))).))))))))))))).... (-43.9)