mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCCTACCCTACCTGAAGACT TCTTTGGGGGGATGGGCAAAG TTTATATATTAGGGTAGTACATTTCCTACCCTACCTGAAGACTTGAGATTATAGTCTTTGGGGGGATGGGCAAAGTACTCTCTTTTTTTGCAT TCAAATAACCACAGACTAATCAGAAACTCCACCTGTGAAAGGAACTTGAAATTGTGCTATTCCTCCAAGCTTATAACACCAGCAAATTGGGTCAATAGGTTATTCCTTTAAAATAGGACTATGAGCCTACAGAGGCTCACTCTGAAGAACTCAGCCGTGGAGTTAGTTCTGCACTATATCCATCACAACAGACATGCTTCATCCCATAGACTTCTTGACATAGCTTGAAATGAGCGAACCCATCCTTGATTTATATACATATATGTTCTCAGTATTTTGGGAGCCTTTCCACTTTTTTAAACCTTGTTCATTATGAACACTGAAAATAGGAATTTGTGAAGAGTTAAAAAGTTATAGCTTGTTTACGTAGTAAGTTTTTGAAGTCTACATTCAATCCAGACACTTAGTTGAGTGTTAAACTGTGATTTTTAAAAAATATCATTTGAGAATATTCTTTCAGAGGTATTTTCATTTTTACTTTTTGATTAATTGTGTTTTATATATTAGGGTAGTACATTTCCTACCCTACCTGAAGACTTGAGATTATAGTCTTTGGGGGGATGGGCAAAGTACTCTCTTTTTTTGCATCTTTTAAATTGTGATTTTTAAAAACACATATAAATTTTACTATCTTAACCATTTTTATGTATATAGTTCAATGAGATTAAGTCCAGTCACATTGGTGTGAAACAG 2 1 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3685 2e-29 -27.2 ..........((((.(((((.((.((((.(((.((((((((((.........))))))))))))).)))).)).))))))))).......... (-27.2)