mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACCACAATTACTTATGC AAACGTAATTGCAGGTTTTGCC TATAGATGTATTAAGTTGGTGCAAACGTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAACTCATGGCCAAAACCACAATTACTTATGCACCAACCTAATACATGTGT AAAAACAAATCCAAGGCCACATCATAACTTCTGAACAAGTGTGTGCCCGTATATATATATCTATATAGATGTATTAAGTTGGTGCAAACGTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAACTCATGGCCAAAACCACAATTACTTATGCACCAACCTAATACATGTGTGAACAACAGCGAACGATGTCAAACTACTTAATTTCCTTTCTGTACAATAAACTTCCTCACTTTGAAACCAACATTTTGCTTGCTCAACATGTGTTCTTCTTCGGGTTGTTTGATCCCC 4 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000001 mml-mir-548d 0.0000000003 -38.5 .(((.((((((((.(((((((((...(((((((..(((((((((((.......)))).))))))).)))))))...))))))))).)))))))).))) (-38.5)