mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGAACCACAATTACTTTTAT AGAAGTAATCACGGTTCTTGC GTGCCTATAGTCCCAGTATATTAGGTTGGTGCAGAAGTAATCACGGTTCTTGCCATTAGAAGTAATGCCAAGAACCACAATTACTTTTATACCAACCAAATACTTTGGAGGCTAAGGTG CCTCATGCCTGTAATCCAGCACTGTGGGAGGACTTGCTTGAGGCCAGGAGCTTCAGAGATCAGCTTTGGCAACATAGCAAGACCCTATCTCTACTAAAAAAATTTTAAAATCAGCCAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTATAGTCCCAGTATATTAGGTTGGTGCAGAAGTAATCACGGTTCTTGCCATTAGAAGTAATGCCAAGAACCACAATTACTTTTATACCAACCAAATACTTTGGAGGCTAAGGTGGGAGAATGGCTTGAGCCCCGGAGTTCCAGTTTGAACCATGATTGCAGCCATTGCACTCCGG 4 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.00000000000003 mml-mir-548d 0.0000000004 -47.6 ..((((.(((((((((..((((.((((((((.(((((((((...((((((((.(((((....))))).))))))))...))))))))).)))))))).))))..)))).))))))))). (-47.6)