mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTTCTTTTGGCTTAAGAT CTGAAGTCGGGTAGCATGAT GCCTTGTAGTATAGTCTGAAGTCGGGTAGCATGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAAGATTGACTTGGCGAT GGCCAGTAATGATGATCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCGCCCACTTTTTGGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAGTTTGTTGGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGACGAGTAGGTTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGACATGAAGTCCTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGGCATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATGTAAGTCTTGAATCCATCTTGAATTAATTTTCGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACTTCTGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCTCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATGGTTGTAGATATGTGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACTAGTACCATGCTGTTTTCATTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTCTGAAGTCGGGTAGCATGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTAAGATTGACTTGGCGATGC 4 1 3' arm Homo_sapiens mirnest 7SK 0.00006 100 -21.6 (((....(((.((((((.((((((((.((((....((.....))..))))..)))))))).))))))))).)))... (-21.6)