mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTGCCTGCCTCTGCCTC GGATGGGGCAGGTGGATCATC CAGCACTTTGGGAGGATGGGGCAGGTGGATCATCTGAGGTCAAGAGCTTGAGACCAGCCTGGCCTCATGTAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAAGTGCT GATAGCTACAAAGCCATGAGTAGCCATGATATGGTCATTATGCTGTCAGCTTCTGTTTTACCTGTAAAACAAGAGTAATGACACCTATCCGGAAGATTGTTGTGGGCCTTACACAGGATAACGCACACACAAGATGTATGGCAGAACACTGTATCAGGTCTATCAGTTTAATACCTTTCTGATATTAAGGTGATAGAACTTTAAATATCCATGCATCATTTCTAAAATTTATAAAATAAAAACTTTAGAAAAAAAAATTAGTCTTTCCAGGCACGGTGGCTCATATCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGATGGGGCAGGTGGATCATCTGAGGTCAAGAGCTTGAGACCAGCCTGGCCTCATGTAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAAGTGCTGG 3 0 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 2e-17 hsa-mir-5096 0.000001 -61.7 .((((((((((((((..(((((((((((((.((.((((((((...(((.......))).)))))))).)).)))))))))))))..)))))))))))))) (-61.7)