mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGTGCTGGAATTAAAGCCAG GGCTAATTTTTGTATTTTT CCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGATAGGGTTTCACCAGGTTGTTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCCTCCTAGAGTGCTGGAATTAAAGCCAGCCTGGGTGTGAGCCATTGCACCCAGCCAAAACTTTTAAT CCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGATAGGGTTTCACCAGGTTGTTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCCTCCTAGAGTGCTGGAATTAAAGCCAGCCTGGGTGTGAGCCATTGCACCCAGCCAAAACTTTTAATTATGAAATTATTTTAGATTCACAGTAAATTTGCAAAAATATGCAGAAGATTTCTGCATACCCTTCACCCAGTTCCCCTAATGTTAGCATCTTACATAGCTATAGTAGAATGTTTGAAACTAGGCAATAGGAAATACTGAATACTGATATAGTGCTATTAGGTAAAATATAGGCCTTATTTTAAATTTCATTTTTTCCAGTAATGTCTTTTTCTCTATTCTGAATCCCATACTGT 1 2 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 0.000000000009 hsa-mir-5096 0.000000007 -42 .((((((((((((.((((((...........(((((.....(((((..((((.((.....)).)))).)))))...))))))))))).))))))..)))))).((((((((((....)))))))))).............. (-42)