mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACCTGGGACTCGGACAGCTG GCTGCTCGATCCACTGGTCCAG GCAGAGGCTCTTGACCTGGGACTCGGACAGCTGCTTGCACTCGTTCAGCTGCTCGATCCACTGGTCCAGCTCCTTGG TCATGAAATTGCCCATGCACATCTCCACAGACAGTAACTGGACATCGAACCTCTTGCACGTTGGATTCTTTTGTCAGGATTTCTTTAGCCTTCTCGCAGAGGCTCTTGACCTGGGACTCGGACAGCTGCTTGCACTCGTTCAGCTGCTCGATCCACTGGTCCAGCTCCTTGGTGAACACCTTCTCGTCCAAGACGAT 4 2 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3661 2e-38 -27.7 ...((((..((.((((..(((.((((.((((((...((....)).)))))).)))))))...)))).))..)))).. (-27.7)