mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGGGTTAGGCTCTCGGGAGC CCCTGAGACCCTAACTAGTGA GCGCGCTCCTCGTCAGTCCCTGAGACCCTAACTAGTGAGGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTCGGGAGCTGCGAGTCGTGCTTTTGCA GCGCGCTCCTCGTCAGTCCCTGAGACCCTAACTAGTGAGGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTCGGGAGCTGCGAGTCGTGCTTTTGCATCCGGTGAAATGGGGTGGAATTTTATTCGTTTAGAAGCAAATAACAAGAAGAAAGAGAAAGTTTGTACTGAGGTGGATTGAGTTATACCGTCTGAGTGTTTTCATGTGTTAGAGTGGGATCAGTGTGACCGAGAGAAGTGGCA 3 0 3' arm Homo_sapiens mirnest lin-4 2e-20 age-mir-125b-1 6e-33 -43.5 (((((...((((.((((.(((((((.(((((((.(((.((((((.....))))))))).))))))).))))))).)))))))).)))))....... (-43.5)