mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTAATAAAAATTTAATTTG AATTAACTTATTTGGCAGAT ACAGGCTGTATTTGTAATAAAAATTTAATTTGTGGGGGGATACTGTAATTTTGGAGCAGTCATCTGCAAATTAACTTATTTGGCAGATACCAATGT CCAGAGGATCCCGCCTTACCACAGGCTGTATTTGTAATAAAAATTTAATTTGTGGGGGGATACTGTAATTTTGGAGCAGTCATCTGCAAATTAACTTATTTGGCAGATACCAATGTCAAATTGGTATGAAACAACAGGAAAGTAAAGCATATTATAATATTTTCCTTAAAAATCATGGAAAGGTGATATAACACCCTGAAGCCTGAAACTGCTGTCGTTAGTGCCAATGACTATACTGATTTTTAAAAATCTGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCGAGGT 4 1 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 100 -23.6 (((....((((((((...((.((.((((((((((((..((..((((.........)))))).)))))))))))).)).))..))))))))...))) (-23.6)