mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GGATCTTGCTCTGTTGCCCAG TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGAGGCAGGAGAATGAACCCAGGGGGTGGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTTCAATCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAGCAAAACAAAACAAAACTAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGAGGCAGGAGAATGAACCCAGGGGGTGGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTTCAATCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAGCAAAACAAAACAAAACTAAATACCCAGCACTCTTGTAGAGTCCCTAAGTCCAGGGTGAATGCTAAATGGAACCTGGCTGAAAGCATATCAGTTGTGGGTCCAACAGAATCTGTTTGGTGGTAGAAGACACAGGCATTCATGATTTTTGCTTGCCTCAACCCTAATGAAACAATTCTGAAATGACTTTCAAATGTAAGGGAAATGAGATTTGCATAGCTAGCCTGGGAAAAGCATAATAT 1 0 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 3e-21 hsa-mir-1273 2e-16 -72.9 ..((((.((((.((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((......)).((((...)))).(((((((((((........))))))..)))))..)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).)))).))))......... (-72.9)