mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GAGTCTCGCTCTGTTGCCCAG TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCCGCCTCAGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCAGCCAAGATCACGCCTTTGCACTCCAGGCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGCCTCAAACA TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCCGCCTCAGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCAGCCAAGATCACGCCTTTGCACTCCAGGCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGCCTCAAACAAACAAATAAAAATGTTGGGGAAAGGAAGAGAAAGCCAGCAACTTCCTGGGTATCCAAGTCAGGCACATCAGCAGGTGTTTGTGTGCTCCCCCCAGCAAGTTCCTCACCTCCTTTACCAGGGGTT 1 0 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 2e-44 ppy-mir-1273 3e-24 -117.1 ((((.((((((((.((((((((((((.(((((.((((((((((((.(((((.(((((((((((..((((((((((.((((...............))))..))))))))))..))))))))))).))))).)))))))))))))))))........((((.........)))).)))))))))))).)))))))).)))).... (-117.1)