mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GAGTCTCGCTCTGTTACCCAG CAGACAGAGTCTCGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGACCTCAGCTCACTGTGTCTCTGCACTGCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA CAGACAGAGTCTCGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGACCTCAGCTCACTGTGTCTCTGCACTGCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAACACAACAAAACAAACAAACAAAAAACACTCCCAAGGCAAATGATTTCATGTCTGGAATTAGCTTTAAAATACTCCAGCAAATAGTGTAAATTAGTACAACCACTCCGGGAAGCTCTTTAGCACTGTTATAGGTTGCAGTGTCTCTCCCATTCCCCCACCCACACTCCCCAGGCCCAGTCTTGAGGCCCATGGACACCCAGAGCCACTT 1 0 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 3e-17 hsa-mir-1273e 0.0000000004 -70.4 .(((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((.((((((............)))))).))))))).)))))))))))))))))).)))))))))))...... (-70.4)