mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAG ATTTTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTGAGAAAAAAAGAAAGATAAATTATAC ATTTTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTGAGAAAAAAAGAAAGATAAATTATACATATGATTGATATACAAGCAAATTATATGTATTCACACATATATAGTTTCCTTTTGGAAGATTTTAGGAAAATATTTGTCACAATTAATGATTTTTATATTTTATTTATAAATTGAGTACTTTGACAAAATATTATATTAAATGGTTCAGTAAGACTGAACCATATATGATGTACTTTTATATGTTATTGCATTTTTAAAAATCTGTAATTTTCAATAACAAATCTCAAAATATGAAAATAAATTTCTTGGTTTGGCACAGTGGCTCATACCTGTAATTCCAGCACTTTGATTGG 1 1 3' arm Homo_sapiens mirnest U2 1e-26 ppy-mir-1273 0.0000000004 -54 .(((((.(((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((.((((....(((((((.......)))..))))...)))))))))))))))))))).))))))))))).))))).))))).............. (-54)