mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAG AGATGGAGTTTGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA CAGATGGAGTTTGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGGCCCTATTTTCCCCATATTCTAGGATTCTAGGGCTCTATGAATCCACTCCCTCTGTCTACACAGGCAGCGTCAGGAAAGAGTGCTGGTTCTGGAGTCAGTCAACCTGGGTACCGGCTGTAGGACCTTAAGAATGGGACTTAACCTCTCTGGTGCCACAGTCAGCTTACCTGTGATTTGGGAGAACCCCTCCTCACAGTGACTGAGTGCGGCTGTGTAAGTTGAGTACCTGCCACAGTAGCTGGCACATGTCCTCTTGTCTAGGGAACAGATTTACTACACGCACACAATGCGCCAGACACTGTTCTTGGTGCTGTTTACAGCAGCAAATCAGAAGAACATTACTG 1 1 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 3e-26 ppy-mir-1273 0.000000000001 -51.6 .....(((..((((((((.(((((.(((((((((((.((((((((.((((.........)).)).))))..)))))))))))))))))))).)))))))).)))..... (-51.6)