mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGACAGAGCAAGACTCTG GTCTCGCTTTGGCACTCCA TTTTTGGTTTGTCGTGTTATGTTTTTAAGACAGTCTCGCTTTGGCACTCCAGCCCGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTTCAAAAAAAAATAATAATAAATAAAG GGCGATCAGAGGACCCCGAACATGTCGATGGCTAGCAACTCTAGGGTAGTTTTTGGTTTGTCGTGTTATGTTTTTAAGACAGTCTCGCTTTGGCACTCCAGCCCGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTTCAAAAAAAAATAATAATAAATAAAGGGATCTGGACTTTCACAGCTTTTTGCGTTTTGCAGCATCATATACAGCAGTCTCCAATTTGAATGGAGACATGTGCTGTAATAAGAATAGCTTCAGGCCAGGGCAGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAACATTTGGGGACTTTGAGGTGAGCAGATTGCTAGAGCTGCAGAAGTTCGAGACCAGTCTGGGAAACATGGCAAAACTCTTGTCTCTACAGAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTAGCAGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCTGGGAAGTCGAGGCTGCAGTGATCCATGACTGCATCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAATGAGACCCTGTCTCAAAGGAATAGCTTCATTTTTGTTCTAGCACTTTGCACTACACACTTTATGGGTGTTTCTCATTAATCTTTACAGCCGA 2 2 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 0.0000000004 ppy-mir-1273 0.000000005 -30 ......((((((..((((((.((((.((((((((((.((((((.(((((......))))).)))))).))))..)))))).))))....)))))))))))).... (-30)