mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTTGTGTTGTTTTCTTTTCC TGAAAAAGGCGTTTGCACTCCA GGTGAAAAAGGCGTTTGCACTCCAATTTTGGCTTGTGTTGTTTTCTTTTCCTTAATATTA GGTGAAAAAGGCGTTTGCACTCCAATTTTGGCTTGTGTTGTTTTCTTTTCCTTAATATTACATTTTGATCATTTAAGGGCATTAAATTGGCTTGTTTTGGTCAGGTGTGGTGGCTGCTCATGCCTGTAATACCAACACATTGGGAGGCCAAGGTGGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGTTCGAGTCCAGCCTGGGCAACATGGCACGAGACCCCATCTCTATTTCTAAAATAATAATAAATTCGGTTATTTTGAAGCTTTTTCAATTTGAGGATGCTATAAAAACTTAGACTTGTTGCTTGAATCTTCCATAATAGTATGTAGGAGCAATTTCTCTAAACAGCATTTTAAGTTATTTATTTGTGGGTTTTTAAAATGTCAACAAAATGCATGGCAGTATTTATTTTTTATATCTTCATATAAAATTAAGTAAATTATAGCATTATGAACATTTTA 5 1 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 100 -13.7 ((.(((.((((((..((((..(((....)))..)))).)))))).))).))......... (-13.7)