mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGGACATACTTATACTAAA TTAGTATAAACATGTTTCCTAC AGCAAAATAAATGAGAATTTTAGATAAACAAGCAATACTTTTTTAGTATAAACATGTTTCCTACAGTGTTTGGGACATACTTATACTAAAAAGTGACTGATCCTTTGCCTGGAATTCACATTTACCTGG TTTTCCATGTAAATTTTTAAACTATCTTATTTTAGGAGCTCCTATGATGTCCATGTTTTGTCCCAGACAATAAGGACTGGACTCAAACAAGAAGGCTCCGCTCTCAAGAGCTCAAGGTCTAAGGGGAAATCTGATATTGAATACATCATGTCAAATTAATGCAGGGAAAGACACAATAGAGAAAATACAGCAGGAAGTGAAAGTAGAGTATTCCAGTCAGGACAAATGCCATGTGCAAAGGCCCAGAGGCCAGGAAGGGTGATTTGAGCAATGCAGAGAGGAAAGAACATAAAAATAGGGTGGCCAGATTTGGCAGATAAGATACAAAACAGCAAAATAAATGAGAATTTTAGATAAACAAGCAATACTTTTTTAGTATAAACATGTTTCCTACAGTGTTTGGGACATACTTATACTAAAAAGTGACTGATCCTTTGCCTGGAATTCACATTTACCTGGGTGCCCTGTATTTTATGTGGCAACCCAGTGTCTTCCAGAGTGCCATCAGCCTGCCCTTCACAGACATGCCCTCCCAGCTATGCCCCCAGCAGAGATTTCTCATCTGCCT 4 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-1302 0.00003 eca-mir-1302-1 0.000006 -27.6 .......((((((.(((((((((.((((....((.((((((((.(((((((..(((((((..((...))..)))))))..)))))))))))))))..))....)))).))))))))).))))))..... (-27.6)