mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGGACATACTTATGCTAAA TAGCATAAATATTTCCCAAGC GCCAGATTAAAATACGGGATGCCCAGTTAGTTTGAATTTTATATAAACAACGAATAATTTCGTAGCATAAATATTTCCCAAGCTTAGTTTGGGACATACTTATGCTAAAAAACATTGTTGGTTGTTTATCTGAGATTCAAAATTAAGCATTTTATATTTTTATTTGCT GCACGAGGTTTACCACAATTTTTAAAAAGCTAGTGAAAAGCTGGTAAAAAGAAAGAAAAGAGGCTTTTTTAAAAAGTTAAATGTATAAAAAGAGCATCATCAGTCCAAAGTCCAGCAGTTGTCCCTCCTGGAATCCGTTGGCTTCCCTCCGGCATTTTTGGCCCTTGCCTTTTAGGGTTGCCAGATTAAAATACGGGATGCCCAGTTAGTTTGAATTTTATATAAACAACGAATAATTTCGTAGCATAAATATTTCCCAAGCTTAGTTTGGGACATACTTATGCTAAAAAACATTGTTGGTTGTTTATCTGAGATTCAAAATTAAGCATTTTATATTTTTATTTGCTGCCTCTGGCCACCCTACTCTCTTCCTAATACTCTCTCCCTCTCCCAGTTTTGTCCGCCTTCCCTGCCTCCTCTTCTGGGGGAGTTAGATCGAGTTGTAACAAGAACATGCCACTGTCTCACTGGCTGCAGCGTGTGG 4 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-1302 0.0002 hsa-mir-1302-3 3e-67 -54.1 ..(((((.((((((.(((((((........(((((((((((.(((((((((.((((((....((((((((.(((.((((((((...)))))))).))).))))))))......)))))).))))))))).))))))))))).....))))))).)))))).))))).. (-54.1)