mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACAAATCACAGTCTGCCAT GGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT GATGTTGGCCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTAAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCATGCCT GATGAGCCTTTAGAAGGATCCGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATACAGAATGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGGTCAGTTTAAGTTTAGCTTTGTGTTAGCTTATACATACTAAAACCTTTAAAAAGCTTTTCTTCTCAATTGATTTTTTTCTTTTAGAAGCCATGGTGTCTCAACCTTTTGGGGACCTAACTTCTAAACATTCTAATAGTTTGCCTTAATTTTTCTTCTGCTTTCTTACTAAAAACGAAGACATTCAATACTAATCTTGCTGGAAGAAGCCTTAACCAAGCAAACTTCTCATTTCTCTGGTGAAAACTGCTGCCAAAACCACTTGTTAAAAATTGTACAGAGCCTGTAGAAAATATAGAAGATTCATTGGATGTTGGCCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTAAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCATGCCTCTACAGGACAAATGATTGGTGCTGTAAAATGCAGCATTTCACACCTTACTAGCATTCTTTGTCTTTTCTACCAAATATTAACAACTTTCAATTCCGTTTTCTTAATTCTGTTCTACTAATGTCCGATTTACTACTCATCATTTTTCTTGACACTTAACATTGCTTTANATTTGTATTGCTAATGGTTTTTGAACTCTTCTAATTTGTATGGACGTGTTTATCATTTTAATTTAGCATTGAATTTGTCTGATGTTGAT 1 2 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-7 3e-38 lla-mir-7 1e-52 -39.7 .....((((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))))))))..... (-39.7)