mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCTGCATTTTTAACAAGCT CTTGTTAAAATGCAGATTCT ATCATCTGAGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCTGGCTCAGAAGTTCCCTGGTGGGGCTGAGAGTCTGCATTTTTAACAAGCTCCCAGGGACC ATCCCCCTTCATCCTTTTTCCATGTGCTCCTTGGAGAATAGGACAAATTCCTCACTCCAGAGGACTAATACCCAAGCCCGGTGGTCTCCTAAAGCAATGCTGCTCATACTTAATCATCTGAGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCTGGCTCAGAAGTTCCCTGGTGGGGCTGAGAGTCTGCATTTTTAACAAGCTCCCAGGGACCACTCCAGTGGACACCAACTCTTAGCCCTCACCCCTAGTTCCTCAGCCCCCTCCCCACACTCAGCCTAAGGGCAACTCACACTGTGTCTCTAGAAGTTCTCTAGTAGCCTTTGAAGAGAGGGTGTTACAGCTCTTTTAAAACACAAAACCANCCCCTCAGCAG 1 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-544 0.000000000001 100 -35.9 .((.((((.(((.(((((((((((((((((((((((((...............))))).)))))))))).)))))))))).))))))))).. (-35.9)