mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGTTAAAATGCAGATTCTG AGAGTCTGCATTTTTAACAAGCT CATACTTAATCATCTGAGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCTGGCTCAGAAGTTCCCTGGTGGGGCTGAGAGTCTGCATTTTTAACAAGCTCCCAGGGACCACTCCAGT ATCCCCCTTCATCCTTTTTCCATGTGCTCCTTGGAGAATAGGACAAATTCCTCACTCCAGAGGACTAATACCCAAGCCCGGTGGTCTCCTAAAGCAATGCTGCTCATACTTAATCATCTGAGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCTGGCTCAGAAGTTCCCTGGTGGGGCTGAGAGTCTGCATTTTTAACAAGCTCCCAGGGACCACTCCAGTGGACACCAACTCTTAGCCCTCACCCCTAGTTCCTCAGCCCCCTCCCCACACTCAGCCTAAGGGCAACTCACACTGTGTCTCTAGAAGTTCTCTAGTAGCCTTTGAAGAGAGGGTGTTACAGCTCTTTTAAAACACAAAACCANCCCCTCAGCAG 0 2 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-544 0.000000000002 100 -36.2 .............(((.(((.(((((((((((((((((((((((((...............))))).)))))))))).)))))))))).))))))(((....)))... (-36.2)