mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGTTAAAATGCAGATTCAG GCTTCTGCATTTTTAACAAGTC ATTACCTGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCAGTCTGCATAGGCCTGGGGTGGAGCCTGAGCTTCTGCATTTTTAACAAGTCTCTAGGGG GTAGGGATGGGGTTTTAGCCCGGGCTAGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGCAATCTGCCCACTTTGGCCTCACGAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCCTGCCAGCTTTGTATAAGCNTGAGGAGTTCTAAAAAATACCTAGACTCAGGGCAAACCCCAGACACTTAAATCAGATTCTCCGGGAGATGAAGCCCAGGCACTGGTATTTTTAAAGTCTCTACAGATGGTTCTAATGTGCTGCTAAGTTAGAGAACTGCTGATCTAGACCAGGCCTTTTCAAACTTAATGTGCACGTGAATTACCTGGACCTTGTTAAAATGCAGATTCAGTCTGCATAGGCCTGGGGTGGAGCCTGAGCTTCTGCATTTTTAACAAGTCTCTAGGGGATGCTGCTGCATCTGGGCTGCTAACTACACTTGGAGATAGGAGGTTCTGGAGGGCAGAGGAAAGAGCATGAACCATAACCTAGGTCCTGACTTCCGAGCCAAGGTTTGCCTTTATGTGGCTGGCAACTTGCTTGG 5 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-544 0.00000008 100 -33.3 ....((((((.((((((((((((((((........((.(((((((.....)).))))).)).)))))).))))))))))..)))))).. (-33.3)