mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGTTAAAATGCAGATTCAG GATTCTGCATTTCTAACAGGCT AAGCATTGCTTCTCACACACTTTAATGTGATCTTGTTAAAATGCAGATTCAGAACCCTGGGGATGGGGCCTGATTCTGCATTTCTAACAGGCTCCCAGTTGACGCCAACACTGCTGGTCTG CATAAAAGAATCCAACAAAGCATGTACTCAGACATAAAGATTTTGGAGGGGTGAGCAAGAAGTTGCAGTAAAATCGTACCTTTTTTTTTCTTCCTGTAAACTGTCTTTGGTTTATGAGCCAAAGAATGAGTTTATAAGAGGCAGAGCAAAGAATAGGGGAGTAGTGAATTTGTTGTACTTAAGTGGGATGTCAACTTCATAATATAAAAATGAACGTTTCAGCAAATAGAGCTGCTCACTCAGAAAGGGTGGCCTATGTAACTTGGGGTTCCCCATCATTGGCCGTGTTTAAGCCTAAGTGGCATATCTGGTTAGAAATGGATTACAGTAAACAGTATTCCTGTATCCTTCATTCCGCAAATGCAAAAGCCTACTCTGTATAAGGTACATGCAGAATATGAAAAGGTATCAAATCTGGATCTGCTCTCTGCCAGCTGTCAAAGCATTGCTTCTCACACACTTTAATGTGATCTTGTTAAAATGCAGATTCAGAACCCTGGGGATGGGGCCTGATTCTGCATTTCTAACAGGCTCCCAGTTGACGCCAACACTGCTGGTCTGTGTAACACAGAGTGATAAACGTTTCTAGAAGGAGACATGCAAATACTTATAATACAAAGGTAAGTACCTTAGGGATTCCACTAATTTTCATAAAAAACCTGGATCCCTCCCAACCCTAGGGCTGTCTTTGCCCTTTTTATACCTTTAGTGTTCCTTCTGATGCTTTGTTGGCTTCTTTTATG 1 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-544 0.00000003 100 -37.4 ((((...)))).(((((........))))).((((((((((((((((.((((..(((((....))))).)))).))))))))).)))))))...(((((.............))))).... (-37.4)