mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTCTGCATTTCTAACAGGCT CTTGTTAAAATGCAGATTCA CTTCTCACACACTTTAATGTGATCTTGTTAAAATGCAGATTCAGAACCCTGGGGATGGGGCCTGATTCTGCATTTCTAACAGGCTCCCAGTTGACGCCAACACTG CATAAAAGAATCCAACAAAGCATGTACTCAGACATAAAGATTTTGGAGGGGTGAGCAAGAAGTTGCAGTAAAATCGTACCTTTTTTTTTCTTCCTGTAAACTGTCTTTGGTTTATGAGCCAAAGAATGAGTTTATAAGAGGCAGAGCAAAGAATAGGGGAGTAGTGAATTTGTTGTACTTAAGTGGGATGTCAACTTCATAATATAAAAATGAACGTTTCAGCAAATAGAGCTGCTCACTCAGAAAGGGTGGCCTATGTAACTTGGGGTTCCCCATCATTGGCCGTGTTTAAGCCTAAGTGGCATATCTGGTTAGAAATGGATTACAGTAAACAGTATTCCTGTATCCTTCATTCCGCAAATGCAAAAGCCTACTCTGTATAAGGTACATGCAGAATATGAAAAGGTATCAAATCTGGATCTGCTCTCTGCCAGCTGTCAAAGCATTGCTTCTCACACACTTTAATGTGATCTTGTTAAAATGCAGATTCAGAACCCTGGGGATGGGGCCTGATTCTGCATTTCTAACAGGCTCCCAGTTGACGCCAACACTGCTGGTCTGTGTAACACAGAGTGATAAACGTTTCTAGAAGGAGACATGCAAATACTTATAATACAAAGGTAAGTACCTTAGGGATTCCACTAATTTTCATAAAAAACCTGGATCCCTCCCAACCCTAGGGCTGTCTTTGCCCTTTTTATACCTTTAGTGTTCCTTCTGATGCTTTGTTGGCTTCTTTTATG 3 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-544 0.00000002 100 -33.9 ....(((((........))))).((((((((((((((((.((((..(((((....))))).)))).))))))))).)))))))......((((....)))).... (-33.9)