mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCAGATTTTGG AAAAACCACAATTACTTTTGC CACAATGACACACTGGTATTAGGCTGATGCAAAAGTAATTGCAGATTTTGGCATTACTTTTATGGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACCAATCTAATAATTTGATGTTTGCCA AAAAAAAAATAGCTTGTTTTGTACCCCCTTGGAGAAGCTGTATTCATATTCATCAATAGATATTTATTAATAAATGAAAAAGGTGTAATTGGTATCTATGTGATTCTAAACAACTAATTGAAATTTTGAACACAATGACACACTGGTATTAGGCTGATGCAAAAGTAATTGCAGATTTTGGCATTACTTTTATGGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACCAATCTAATAATTTGATGTTTGCCAACTTAAAAAATTGTTTTGTTGGTATCAGCTACTATTTAGTTCAGCAGACATTACTCTAGCATCTTCTGTGTTTCAAGTACAATGCTAGGGTGCTGCATATAAAAAAAATTTCAAGGGAAAATTCTTGGTCTTGGGAAAGTTATCTAATAGAGATAGATATATAAATATATCATTTCATTATAATATGGGAAGTAATACAATAGAAGAG 5 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 7e-18 hsa-mir-548f-4 6e-18 -27.7 ......((((((....(((((((.((.((((((((((((((....(((((.(((.......))).)))))....)))))))))))))).)).)))))))...)).))))..... (-27.7)