mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAACCACAATTACTTTTGC AAAAGTAATTGTGGCCTTTGC TTAGATTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCCTTTGCCATTACTTTCCATGGCAAAAACCGCAATTACAAAAGCCGCTACTTTCAATAGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACCAACCTA GTTTACATTGACATTTTTCATGCCCCTGAACAGATAAGCTTCCATAATATTTCAGATTTGCCTATTAGTAAGTTAAAATTGATAATGGTTTTTATTTTAGTTTATGTAATCATGCTTATCATAGGAAAAATTTCAGGCAGTTTTAGGATGAACCTTGTTCCCTAAGGGTAATTTAATTGCTTTACTATTAGATTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCCTTTGCCATTACTTTCCATGGCAAAAACCGCAATTACAAAAGCCGCTACTTTCAATAGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACCAACCTAGTATTTAGNATGGATCCTCACAAGGGTTTTACTCTGGGTACTCAAGCGTATGTATATCCAGGCATACTTTCAGGGGGG 5 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 1e-16 hsa-mir-548aa-2 0.000000000000002 -40.1 .(((.(((((((((((((((((((((..((((((((........))))))))....((..........)).((((.......)))).....))))))))))))))))))))).))) (-40.1)