mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGAGGCAACGGTTCATCGATC TGAATTAGCGTATGAATTTGTAAGGTGAAGTCACTGGAGGCAACGGTTCATCGATCTCTTCCTGAATTTGGCTGTGGAATCATACACAAAGCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTTTGCCTCTTTTTCGTGTTTTTCTTTCTTTAA TGAATTAGCGTATGAATTTGTAAGGTGAAGTCACTGGAGGCAACGGTTCATCGATCTCTTCCTGAATTTGGCTGTGGAATCATACACAAAGCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTTTGCCTCTTTTTCGTGTTTTTCTTTCTTTAATTATTTTTTTCTGGTCCTTACGTAGCTAGATTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTGGATTTTTTTGTCTGCGATTGAAGAGCGAATCTTATTATGGTTATCTTCTAGCATTGAGTTAATTTGTGCAATAATCTGCGTTTCTCTTAATGGATAGTGGTTCAATTTCTCTGAAGCTAATGGAGAGACTTAGGTTTGGATAATTGTGATTAAATACATAATTACTCGCGATTGTGTGTTCATTTTGCATCACTTAGGAGCTGT 4 0 3' arm Arachis_duranensis mirnest MIR162_2 0.0000000006 vvi-MIR162 0.000000000000002 -43.8 .(((...(((...(((...(((((((((.((..(((((.(((..((((.(((((((..(((.((..((((..((((....))))..)))).)).)))..))))))).))))..))).))))).)))))))))))....))).)))....)))......... (-43.8)