mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAACCACAATTACTTTTGC AAAAGTAATTGCAGTTTTACC CTGGTCCAAAAGTAATTGCAGTTTTACCGTTCAAAGTCATGGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACTAACCTAA CTGGTCCAAAAGTAATTGCAGTTTTACCGTTCAAAGTCATGGCAAAAACCACAATTACTTTTGCACTAACCTAATATATGCTGTATATAAAGCCTTTAAGAGGCCGGATGTGGTGGCTGACACCTGTAATTCCACCACTCTGGAAGACCAAAGCAGGAGAATTTCTTGAGGCCCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGGCAATATGGCGAGACCCTGTTTCTACAAAAACTAAGAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTGTGCTTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGCCCAGGAGGCTGGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGTCGTGATTCTACCACTGCATTCCAGTCTGGGTGACAGACCAAGACCCTGTCTCAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATAAAGCCCTTAGGT 4 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000004 hsa-mir-548aa-2 0.00000000001 -19.4 .((((.((((((((((((..(((((.((((........))))..)))))..)))))))))))).))))...... (-19.4)