mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGCTTCCATGTTTTGG TAAACGTGGATGTACTTGCT GGCTCCCCACCACTTAAACGTGGATGTACTTGCTTTGAAACTAAAGAAGTAAGTGCTTCCATGTTTTGGTGATGGTAAGT GGAGAACACGAATCTTTGGGAACTAGTTCAGGAAGGTAAAAAAAATTTTTTTCTTCTAAAGTTATGCCATTTTGTTTTCTTTCTCCTCAGCTCTAAATACTCTGAAGTCCAAAGAAGTTGTATGTTGGGTGGGCTCCCTTCAACTTTAACATGGAAGTGCTTTCTGTGACTTTAAAAGTAAGTGCTTCCATGTTTTAGTAGGAGTGAATCCAATTTACTTCTCCAAAATAGAACACGCTAACCTCATTTGAAGGGATCCCCTTTGCTTTAACATGGGGGTACCTGCTGTGTGAAACAAAAGTAAGTGCTTCCATGTTTCAGTGGAGGTGTCTCCAAGCCAGCACACCTTTTGTTACAAAATTTTTTTGTTATTGTGTTTTAAGGTTACTAAGCTTGTTACAGGTTAAAGGATTCTAACTTTTTCCAAGACTGGGCTCCCCACCACTTAAACGTGGATGTACTTGCTTTGAAACTAAAGAAGTAAGTGCTTCCATGTTTTGGTGATGGTAAGTCTTCCTTTTACATTTTTATTATTTTTTTAGAAAATAACTTTATTGTATTGACCGCAGCTCATATATTTAAGCTTTATTTTGTATTTTTACATCTGGTAAGGGGCCCCCTCTACTTTAACATGGAGGCACTT 2 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-302 1e-27 mml-mir-302a 1e-33 -33.8 .(((..(((.((((.(((((((((.(((((((((((.........))))))))))).))))))))).)))).)))..))) (-33.8)