mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGACGTTGGCTCTGGTGGTG CCACTCCCCTGCAAACGTCCAGT GAGCAGTCTCCACCACTCCCCTGCAAACGTCCAGTGGTGCAGAGGTAATGGACGTTGGCTCTGGTGGTGATGGACAGT GGGCGGTCGGTCGGTGAGGCTTTCCCGGCTGTGGTTTGGCTGCGGGCGGCTTGGGCAGCCCGCGGGCGCCTCAGGTAGAAGAAGAAAGGTGCCACTCCGGCATGAAGACAGACTCGCTTAGTCGCCAGTCACTTAAGCTGAGTGCATTGTGATTTCCAATAATTGAGGCAGTGGTTCTAAAAGCTGTCTACATTAATGAAAAGAGCAATGTGGCCAGCTTGACTAAGCCGCCAGCGCACAGCGCGGCAGGACGCGCCCGGGTCTCAGCGGACTTGTGCATGTTAGCTCGTGTAGATTTATGTGAGGGCTTGTAAAACTCTGGTCTTGTAAACTAGTCTTAAGCGCTTTTAATATGGAGACAGATGAGAGCCCCTCTCCGCTCCCGTGTGGGCCCGCAGGAGAAGCGGTGATGGAGAGCCGAGCTCGCCCCTTCCAAGCGCTGCCCGTGAGCAGTCTCCACCACTCCCCTGCAAACGTCCAGTGGTGCAGAGGTAATGGACGTTGGCTCTGGTGGTGATGGACAGTGCGAACTCCCTGTGAGGACCCCTTCAACTTCTACGGAGCTTCTCTTCTCTCCAAAGGATCCTTCTCTAAGGGCCGCTCCTCATAGACGAACTGTAGTGGCCACAGCCCGCGCACCGCCGGACGCACCTGGGTCCGGAAGTTCTCCCCTGACTTAAGGTGGTTAAGGATGTAAAGATTAGGTGAGCTTACCGAGAGTGCAGGAGTAAGGCCAGGAGGTGCTGCAAGGGAGAAGGCCACGGCGGCGGAATGGGGCTGCCTAGCCGTCGGGGGAAGCGATGTCGTGCCTCGGCGGGTCTGGCCACGGCAGGCATGCGGGCAAGCGCCACCGAGAGGGCAGGCGGGCGACACAAAGGTGTGTGGCAGGTGATCTAACGCGCATGACAGGGCGTAACGCAGAGGGAGACTGCAGAA 4 2 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-1306 2e-26 hsa-mir-1306 8e-35 -29.8 .....((((.(((((((.....((.((((((((....(((....))).)))))))).))...)))))))..))))... (-29.8)