mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGTAGTAGGTTGCATAGT TATACGACCTGCTGCCTTTC CCAGCAAGAAAAAAAAAATGGGTTCCTAGGAAGAGGTAGTAGGTTGCATAGTTTTAGGGCAGGGATTTTGCCCACAAGGAGGTAACTATACGACCTGCTGCCTTTCTTAGGGCCTTATTATTCACCGATAACCT TAGTGGATCCAAAGAATTCGGCACGAGGGTTAAAAGTCAGCGACTCCAGTAATACGTGGTGGGCTGAGTATTAGACTACTGGCTTACACCAGCTGATGTCATTACTTTCTTGTTCGTTTGTGACTTGAGGTTGGATTTTAAGCAAATGTATTTGTGGCTTTTTACCAAGGTCATATGGCCAGATAACTTTTCAAAAGCATTAGTTAAAGAATTCTGATTAGTTTGAATTAGAAACAAAACTCAAAGAACATGACCTAATTTAACAGGTTAATTTGAAGTGCATCTGCCAAGTAGAAGACCAGCAAGAAAAAAAAAATGGGTTCCTAGGAAGAGGTAGTAGGTTGCATAGTTTTAGGGCAGGGATTTTGCCCACAAGGAGGTAACTATACGACCTGCTGCCTTTCTTAGGGCCTTATTATTCACCGATAACCTGTTTCCTTGCTACTTTGCTTTGGTGTAAGCAGAGTTCTTTCTGTAGGTTTTTTCAAATGAAAACATTGCAAGAATATCAAAGAGAGCAGTGTTTGCGTTAGTGATTATAAACTGCAGCATGGTGCTGACATTGATAACTGAAAGTCAACTAATGAGAATTTGAGACTTCTGAAGTACACTTAGTTGCTAGTGTCTCCCTTTTGGTGTCACTGGAAAGTTT 1 1 5' arm Homo_sapiens mirnest let-7 2e-34 mmu-let-7d 1e-47 -44.8 ................((((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((...((((((.....))))))..........)))))).)))))))))))))))))))))).))))))............... (-44.8)