mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGGCCGTAGCACTGTCTGA ACAGTGAACCGGTCTCTTT TTGTTCCTGAGCTGTTGGATTCGGGGCCGTAGCACTGTCTGAGAGGTTTACATTTCTCACAGTGAACCGGTCTCTTTTTCAGCTGCTTCCTGGCT TTTAAACCTTTATCATAAAATGTATGCTTTGAATACTGTGAAGTACACTGCATATAAGGAGTGTGGTATAGTATAAAGAAACTTACTGCAGGTAGTAATTATAGTGAAGATTTTAGGTTTACAAAGCCCTAGCTGTTTTCTGTGTAGCTTTTATTATTCTTATGACTCTTGACAAGTTTGTAGCTTCACCATATACATTTAATATTTTGCAATAATTGGCCTTGTTCCTGAGCTGTTGGATTCGGGGCCGTAGCACTGTCTGAGAGGTTTACATTTCTCACAGTGAACCGGTCTCTTTTTCAGCTGCTTCCTGGCTTCTTTTTACTCAGGTTTCCACTGCTTTTTTGCTTTTTTTAATGCTGTATGAAGGTGTTAACATTTGTTTATATTTTTCATTAATTGTAATACCTTTAAATCATGCATCATACTCAGAAATAGGGATTAGAATTTAAGTGACATCTTTGGCCTAATATAATTTACCTGTTAAAAATTTGTGAAAGCTATTGCTTATTTCTTTTCCAAAGTAGATTTGGATGACAAATTCAGTTTGGTTTTGAGCTTATCTAAAAAGCTTAATGTTTTAAGCATACCAAACTCATTAGCAGAAGTCAAATATGTCTCTCCCTATTGCTACACAACTTTTTAGGGATATTGGTATATATGAAAGCATGACATCAAACGGCCTAATACACCTAAATGCATTTGAAGCTACTTGGTCTCGGTCTTACCAACGATATAATTTAATTTTTTTTNCAAACGATGATGNTGGTGCATACCTGTGGNAAGCAAAATGGATTCTG 4 2 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-128 7e-33 age-mir-128 3e-41 -32 .....((.((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).))))...)).. (-32)