mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTAT CTTCTTTACAGTGCTGCCTTG AGCTGCGTCTTTGTGCTTTCAGCTTCTTTACAGTGCTGCCTTGTAGCATTCAGGTCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATGAAAGAACCAAGAATGGGC GGCTGCAGGAATTCGAATTCGGGGTGCCCTCCTTGGCTCCCCCACCTCAGCAGAGCTGCGTCTTTGTGCTTTCAGCTTCTTTACAGTGCTGCCTTGTAGCATTCAGGTCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATGAAAGAACCAAGAATGGGCTGCCCTTGGGAAAAGAGGATCTAGGATCCAGTTGGTGCAGCTTATGGCTTGTCCCTGTGTGTATAGTTGTTAAATTATTCTTTTATTTTTATTTTTAAGAAGTTATTCTTTAGATAATAATAGGCATGTAGCTTAAAAGGAAACCTCAAAAGACACAAAGGATTTGTCTCATTTTAAATTAAAAAAATACTGTATCAGCATCAAGTAATTAAACATTTGTTGGAATATCATAACTTCTTTTTTCTTTATTGTATGTTCCCTTTCCTGTGCTTACGTATTTTCAGAAATTTTAGTTGGTGTGCATACCACAATTTGTATTTTATACTTAAATATACATTTCATGGTTGTATATTTATTTGATCAAGTTCTTTTATATCAAATAACAGAGCTTGGCATTTGGTTGCTTGCTCATAACTCGGCAGTAAGCATTTTT 4 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-103 1e-34 mmu-mir-103-2 3e-41 -32.3 .(((...((((.((.((((((..((((.(((((((((((.(((..((......)))))))))))))))).))))...)))))).)).))))...))) (-32.3)