mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACCACAATTACTTTCGC AAAAGTAATTACGGTTTTTGTG ATCAGATTAGTGCAAAAGTAATTACGGTTTTTGTGATTACTTTCAATGGCAAAACCACAATTACTTTCGCAGCAACCTAA CTCCCAGAGCACTGGGGTTACGGTGTGAGCCACTCCGCCTGGCCTGGCTGTGGGTCTCTAGACATGCTTGTTACCAAGCTGATGACGTTCTGCTCATGACTGGCTGACAGTGCTGCCATAAAAGGTGCTGACTTTCTGAATTTTGTTAAATGCCTTTTCTGCCTTGTTGATGTGACCACATGGCTCTTCAGCCAGTTAATATGATATCAGATTAGTGCAAAAGTAATTACGGTTTTTGTGATTACTTTCAATGGCAAAACCACAATTACTTTCGCAGCAACCTAAATAGATTTTGTTAACAATTCTGAAATGTCAGCCTTGGATTCCTGGAATAAATCTTACTTGATCTTGGTGTAGAATTCTCTTTATATACCGATAAATCCTATTTGCTGAAGTTTGGTTGAGGATCTGTGTGTATATTCATGGGGAATATAGTCCCANGTTTCCCTTTCCGGTGCTGTTTCTGTCTGATTTTGGTATCAGGGTGATAGTATGAGCTTCGTAAAATCAATTAGAAAGTGCTCCGTCTCTCCTGCTTCCTGTGAGAGGGTGGAATTGGCATTCTCTTTCAACATTCGGTGAAATTCTCCAGTGGCCCAGG 3 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000001 hsa-mir-548h-2 1e-18 -17.2 ..........(((.(((((((((..((((((.((.(((......))).))))))))..))))))))).)))......... (-17.2)