mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTACAGTTACTTTTGCACCA GAGCAAAAGTAATTGCGGTTTT CAGAGGGATTATTGAATACTGGGTTTGAGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCCATCATGCCAAAAGCTACAGTTACTTTTGCACCAGCCTAATATTTACTAAGTGCCAG TGTCATGTAGCCGTACATAAAGAGATGGAGGAGAAGCAGAGGGATTATTGAATACTGGGTTTGAGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCCATCATGCCAAAAGCTACAGTTACTTTTGCACCAGCCTAATATTTACTAAGTGCCAGATATTCTTACTTACCTTATTTAAATCCTCACCAAAGACACGAGTTGGAATTTACAAATATGAAAATTGAGGCATAGAGTTAGGTAATTTGCCTGCTATCAGACAGCTAGCAAGAGGAGAACCAGGACGTAAACCTAGGTCTAGGAAGCTATCAACTAAAAATGTCCTGTAAACTTCCTGTACGTCATCCATTGTTCACGTATCATTACTGGGTTGCTGTCCTTGCCCACAATACC 4 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000001 hsa-mir-548v 1e-37 -33.1 .....((.(((.((((((.((((((...(((((((((((((.((((((((......))..)))))).)))))))))))))...)))))).)))))).)))...)).. (-33.1)