mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTGCAGTTACTTTTGCAAA TGCAAAAGTAATTGTGGCTTT TAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCTTTTGCCATTACTTTTAATTAGCTGCAGTTACTTTTGCAAATAGCC TTTCTTTGCTAGTATTTTCGATCTGTAGTTGGCTGAATCTGCATGTGCAGAACCCATGAACATGGGGGGCCAACTATACATTTTATTCTAGGAAAGCAGGTATTGAATGAAGCTGTGGAGAGCGCTTTTTAATATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCTTTTGCCATTACTTTTAATTAGCTGCAGTTACTTTTGCAAATAGCCGTAGAGCATGATCACAGATTGAAAATCTATACACACATATGGTAGGGTTGTTGGAATACTGACATGTCTAGTTTGTGTTGATGGGGAAGTCATTTCACGCTCTTGGTTTTAGGCTACGCTACTGTGGCTTAAATTTCCTCGTGTTTAAGACAACAGTACTCTAGGTTTTCTATAATCACAGGTGTACTCATTGAGTACTTTGACATTTAGGTTCCTAGGCCAAAACTGTAGCAAAGTAAAGAGACCAGGATTGAAATACCACATGGTAAAAGGCTTTTAAAAATCTGATCTAATGCAGATAAGTACAGGCTTTTTGGGAAAGGGGCTAGTGTTTTTAAAGGCCATTTATCAGATGATATGCTTAT 2 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000000001 hsa-mir-548c 0.000000000003 -29.8 ..(((((.(((((((((((((((((((.(((..........)))..)))))))))))))))))))..))))) (-29.8)