mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAAGTAATTGTGGCTTTTG ATTAGCTGCAGTTACTTTTGCA TTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCTTTTGCCATTACTTTTAATTAGCTGCAGTTACTTTTGCAAATAGCCG TTTCTTTGCTAGTATTTTCGATCTGTAGTTGGCTGAATCTGCATGTGCAGAACCCATGAACATGGGGGGCCAACTATACATTTTATTCTAGGAAAGCAGGTATTGAATGAAGCTGTGGAGAGCGCTTTTTAATATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGCTTTTGCCATTACTTTTAATTAGCTGCAGTTACTTTTGCAAATAGCCGTAGAGCATGATCACAGATTGAAAATCTATACACACATATGGTAGGGTTGTTGGAATACTGACATGTCTAGTTTGTGTTGATGGGGAAGTCATTTCACGCTCTTGGTTTTAGGCTACGCTACTGTGGCTTAAATTTCCTCGTGTTTAAGACAACAGTACTCTAGGTTTTCTATAATCACAGGTGTACTCATTGAGTACTTTGACATTTAGGTTCCTAGGCCAAAACTGTAGCAAAGTAAAGAGACCAGGATTGAAATACCACATGGTAAAAGGCTTTTAAAAATCTGATCTAATGCAGATAAGTACAGGCTTTTTGGGAAAGGGGCTAGTGTTTTTAAAGGCCATTTATCAGATGATATGCTTAT 1 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 3e-16 hsa-mir-548c 0.0000000000009 -31.5 ...(((((.(((((((((((((((((((.(((..........)))..)))))))))))))))))))..))))). (-31.5)