mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGGTGCAAAAGTAATTGCC CACATTACTTTTGCACCAACCG ATAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCCGTTTTTGCCATTAAAAGTAATGGCACATTACTTTTGCACCAACCGACCTAATA TGATGACCTTGGTTAATGTTTTTTCATAGGCTCTGTTTCATAGGCTTTGTTTTTTCATAGGCTCTCCCTCATTGCATTGTTCTGAGAATTGAATGTGGCTGCTTGCATGGTAATGAGGGGTTCAACGGAGGCTGTTGGTGGTAGTGATAATACAAGCTGAAAAACTACACAGACAAACCTATCAGTTTCTGCCTCTTCAGGATATAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCCGTTTTTGCCATTAAAAGTAATGGCACATTACTTTTGCACCAACCGACCTAATATG 0 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 2e-17 hsa-mir-548i-1 3e-19 -35.5 ..........(((((((((((((((((((((((((.((.........)).))))))).))))))))))))))))))......... (-35.5)