mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACCACAATTACTTTTGG AAAAGTAATTGCGGTTCTTACC GATGTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTCTTACCATCACCTTTGATGGCAAAACCACAATTACTTTTGGATCACCCTAATAGGA CAGAGTCAACAGTGCCCCATAGAGATCTCAGATCTTCCACATCTGCAGGGAAAGAGAAGGGGTGTGATAATTAGCTTTTGTATGAGGGGTGTTGAGTAGTCTTTCCTGAGATGATATCTGTAAATACGGCTTGAAGTTGATGATGTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTCTTACCATCACCTTTGATGGCAAAACCACAATTACTTTTGGATCACCCTAATAGGAAAGGAGCAGAGTAGGATAGGCATGTTGGGAGAAGTGGAGGACAGGGACGCATAGAATGTCTGCTGTGAGATGACCAGTGACATTCAGCCATTTCCAGTTGCTCGAATGGTGCAGCAGTGACTTTGAAGTGTCCAGATGGGAGTGGAGTGAGTGTCTCCACTTGCA 3 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.00000000000002 hsa-mir-548h-2 0.000000000005 -33.8 ....(((((((.((((.((((((((((((.((((.((.((((((....)))))).)))))).)))))))))))).)))).)))))))... (-33.8)